En la noche también organizamos recorridos fluviales: Navegamos lentamente frente a la orilla buscando caimanes con ayuda de linternas. Estos reptiles salen a cazar en la noche y es más fácil encontrarlos en la oscuridad porque sus ojos reflejan la luz. Existen tres especies de caimanes en la Reserva Nacional Pacaya Samiria, caimán negro (Melanosuchus niger) que puede llegar a los 6 m de longitud, caimán blanco o de anteojos (Caiman crocodilus) que alcanza los 2.5 m de longitud, y el caimán enano (Paleosuchus palpebrosus) con una longitud máxima de 1.5 m siendo la especie de cocodriliano más pequeña del mundo.
Durante la época de máxima creciente los caimanes se adentran en el bosque inundado y es difícil encontrarlos en el río, pero igualmente podemos aprovechar los recorridos fluviales nocturnos para contemplar el impresionante cielo estrellado y relajarnos con los sonidos de la fauna nocturna que habita las orillas.